一、个人简介
张磊，男，博士，教授/博士生导师，入选国家级青年人才计划，获陕西省杰出青年基金资助，主持国家基金面上项目3项，以第一或通讯作者在Nature Communications（3篇）、Microbiome、mBio等杂志发表SCI论文30余篇，以第四完成人获得陕西省自然科学一等奖1项，陕西高等学校科学技术研究优秀成果奖特等奖1项，以第一发明人授权发明专利2项。
二、教育及研究经历
2004年本科毕业于武汉大学生命科学学院生物科学专业；2004-2009年在武汉大学生命科学学院硕博连读，获生物化学与分子生物学专业博士学位；2009年进入西北农林科技大学生命科学学院微生物专业从事教学和科研工作。2015年3月至2016年3月在美国内布拉斯加大学-林肯分校以访问学者进行合作研究。
三、研究方向
以植物根际及内生菌、肠道病原菌为主要研究对象，通过分子生物学，生物化学，生物信息学等手段，研究微生物与宿主、环境三者之间的相互关系，主要包括：
1) 微生物的环境响应及适应机制（主要关注细菌的群体感应与第二信使）；
2) 细菌-宿主跨界互作的分子机制；
3) 内生菌促作物抗旱抗逆机制。
四、教学工作
承担《微生物学》《微生物实验》《发酵工程生产实习》等本科课程；承担《微生物遗传学》《微生物学研究进展》等研究生课程。
五、科研项目
主持国家自然科学基金面上项目：哺乳动物细胞分泌的AI-2信号类似物鉴定及其在宿主-细菌相互作用中的功能研究(32370134)，2024.01-2027.12；
主持陕西省杰出青年科学基金项目：胆汁酸盐通过c-di-GMP信号通路激活沙门氏菌VI型分泌系统的分子机制研究(2023-JC-JQ-18)，2023.01-2025.12；
主持国家自然科学基金面上项目：LuxS/AI-2群体感应系统通过c-di-GMP信号通路调控鼠伤寒沙门氏菌致病性的分子机制研究(32170048)，2022.01-2025.12；
主持国家重点研发计划子课题“难降解有毒污染物智能降解体系的设计与装配(2018YFA0901203)”，2019.07-2024.06；
主持国家自然科学基金面上项目：西北荒漠耐旱植物骆驼刺内生菌Pantoea alhagi LTYR-11Z提高小麦抗旱性的机理研究(31770121)，2018.01-2021.12；
主持国家自然科学青年基金：秦岭“太白七药”内生菌多样性及其功能菌株筛选(31100001)，2012.01-2014.12；
主持陕西省自然科学基金：靶向细菌FabI酶的药用植物内生放线菌筛选及活性代谢产物研究(2016JM3014)，2016.01-2017.12；
主持陕西省自然科学基金：秦岭太白红杉林土壤宏基因组文库构建及生物活性筛选(2012JQ3006)，2012.01-2013.12；
主持中央高校基本科研业务费项目：骆驼刺泛菌T3SS效应蛋白RopAA调控作物抗旱性的机制研究，2019.01-2019.12。
六、近年来代表性论文(*为通讯作者)：
1) Zhang H#, Zhao W#, Yang W, Zhang H, Qian X, Sun K, Yang Q*, Shen X*, Zhang L*. Autoinducer-2 enhances the defense of Vibrio furnissii against oxidative stress and DNA damage by modulation of c-di-GMP signaling via a two-component system. mBio 2025, 16(2):e0292224.
2) Li S, Liu Q, Duan C, Li J, Sun H, Xu L, Yang Q, Wang Y, Shen X*, Zhang L*. c-di-GMP inhibits the DNA binding activity of H-NS in Salmonella. Nature Communications 2023, 14, 7502. (被H1 Connect [原F1000 Prime]推荐)
3) Li S#, Sun H#, Li J, Zhao Y, Wang R, Xu L, Duan C, Li J, Wang Z, Liu Q, Wang Y, Ouyang S*, Shen X*, Zhang L*. Autoinducer-2 and bile salts induce c-di-GMP synthesis to repress the T3SS via a T3SS chaperone. Nature Communications 2022, 13:6684.
4) Liu X#, Liu Q#, Sun S, Sun H, Wang Y, Shen X*, Zhang L*. Exploring AI-2-mediated interspecies communications within rumen microbial communities. Microbiome. 2022, 10:167.
5) Zhang L#*, Li S#, Liu X, Wang Z, Jiang M, Wang R, Xie L, Liu Q, Xie X, Shang D, Li M, Wei Z, Wang Y, Fan C, Luo ZQ*, Shen X*. Sensing of autoinducer-2 by functionally distinct receptors in prokaryotes. Nature Communications 2020, 11:5371. (入选Nature Communications Editors' Highlight)
6) Wang Z, Xie X, Shang D, Xie L, Hua Y, Song L, Yang Y, Wang Y, Shen X*, Zhang L*. A c-di-GMP Signaling Cascade Controls Motility, Biofilm Formation, and Virulence in Burkholderia thailandensis. Applied and Environmental Microbiology, 2022, 88: e0252921.
7) Zhang L#, Zhang W#, Li Q, Cui R, Wang Z, Wang Y, Zhang YZ, Ding W*, Shen X*. Chen C, Qu M, Li M, Wang Y, Shen X*.Deciphering the root endosphere microbiome of the desert plant Alhagi sparsifolia for drought resistance-promoting bacteria, Applied and Environmental Microbiology, 2020, 86:e02863-19.
8) Shuyu Li, Hong Liang, Zhiyan Wei, Haonan Bai, Mengyun Li, Qiqi Li, Meng Qu, Xihui Shen, Yao Wang*, Lei Zhang*. An Osmoregulatory Mechanism Operating through OmpR and LrhA Controls the Motile-Sessile Switch in the Plant Growth-Promoting Bacterium Pantoea alhagi. Applied and Environmental Microbiology. 2019, 85:e00077-19.
9) Lei Zhang#*, Muhang Li#, Qiqi Li, Chaoqiong Chen, Meng Qu, Mengyun Li, Yao Wang, Xihui Shen*. The Catabolite Repressor/Activator Cra Is a Bridge Connecting Carbon Metabolism and Host Colonization in the Plant Drought Resistance-Promoting Bacterium Pantoea alhagi LTYR-11Z. Applied and Environmental Microbiology. 2018, 84:e00054-18. (Spotlight article)
10) 谢来工, 赵文瑾, 张磊*. AI-2通过甲基化趋化受体McpU调控恶臭假单胞菌KT2440的趋化运动及生物膜形成. 微生物学报 2022, 62(2):628-639.
11) 谢晓荣, 尚道涵, 沈锡辉, 张磊*. AI-2通过调节c-di-GMP代谢酶DosC影响类志贺邻单胞菌生物膜形成及运动性. 微生物学报 2022, 62(7):2808-2823.
七、联系方式及招生信息
招收硕士生、博士生，具备扎实的分子生物学知识及实验技能、英文写作能力优秀者优先；也欢迎博士后加入。有意者请EMAIL联系。
地址：西北农林科技大学生命科学学院，陕西杨凌，712100
邮箱：zhanglei0075@nwsuaf.edu.cn